Fehlerhafte Erkennung von Grenzen wenn Zuordnung von Flächen bei Verwendung von intersect

Hallo

Ich habe mich im Moment mit folgender Problematik auseinanderzusetzen.
Mir liegen mehrere polygonshape-Dateien vor, die sich innerhalb von Niedersachsen befinden. Das eine polygonshape bildet Flächen ab, die sich innerhalb und an den Grenzen des ersten befindet.
Mein Ziel ist es nun die beiden polygone so miteinander zu verschneiden, dass nur die Flächen, die sich innerhalb des ersten polygon-shapes befinden mit diesem genau verschnitten werden.
Das Problem, dass bisher auftrat war, dass auch die Flächen, die sich an den Grenzen befanden mit verschnitten wurden. Das möchte ich aber nicht.

Zur Verdeutlichung habe ich eine Karte erstellt:

http://www.bilder-space.de/show.php?file=GKlCTUTvl 76MpH4.jpg

Es geht um die grünen Flächen innerhalb der roten Grenzen.
Diese sollen mit den Flächen mit den roten Grenzen per intersect verschnitten und die Daten, die mir zu beiden Flächen vorliegen richtig zugeordnet werden.
Das Problem ist, sind zwei grüne Flächen durch eine rote Grenze getrennt wird diese nicht als Grenze erkannt und beiden rot abgegrenzten Flächen bei intersect zugeordnet.

Wie bekomme ich es hin, dass wirklich nur die Flächen, die sich innerhalb der roten Grenzen befinden richtig zugeordnet werden und sonst keine
(nichts außerhalb davon)

Für Eure Hilfe möchte ich mich schon einmal im Voraus bedanken.

MfG

Holger